Un elemento importante nella creazione dei khinkali è la formatura. Tradizionalmente, gli chef georgiani li modellano in modo che si formi una piccola "coda" di pasta in cima. Si ritiene che i khinkali debbano avere almeno 18 pieghe alla base (avvicinandosi alla coda). Questo li rende facili da tenere in mano e la coda si raffredda anche più velocemente. La coda poco cotta viene solitamente scartata (la coda è anche un modo comodo per tenere traccia di quanti khinkali si sono mangiati). I khinkali modellati vengono bolliti in acqua bollente (l'opzione più comune) o fritti. Alcuni ristoranti offrono sia versioni bollite che fritte di ogni tipo di khinkali con ripieni diversi.

Una caratteristica del piatto (soprattutto la versione ripiena di carne, e soprattutto quella bollita) è la presenza di una grande quantità di "succo" (essenzialmente brodo) all'interno di ogni khinkali. Di conseguenza, il processo di consumo diventa più difficile e si consiglia di mangiare con le mani: usare una forchetta e un coltello impedirà ai succhi di rimanere all'interno del khinkali.